資料介紹
軟件簡介
這堆代碼用來模擬通過自然選擇進化的生物,不過要注意,這個模擬器缺乏友好的界面,因此編譯和執行程序可能需要格外注意細節。
代碼塊
- src 目錄中的代碼可以被編譯成一個名為 biosim4 的控制臺程序。默認情況下調用時,它將從名為 biosim4.ini 的配置文件中讀取參數(可以在命令行上指定其他配置文件),模擬器會在生物居住的地方配置一個 2D 競技場。
- 類 Grid (參見 Grid .h 和 Grid .cpp )包含一個 16 位索引的 2D 數組,每個非零索引指向類 Peeps 中的特定個體(參見下文)。網格中的零值表示空位置,類 Grid 不包含東西,它只存儲表示誰住在哪里的索引。
- 生物的數量存儲在類 Peeps 中(參見 Peeps .h 和 Peeps .cpp )。類 Peeps 包含模擬中的所有個體,存儲在 std::vector 容器中,作為 struct Indiv 的實例,類 Grid 中的索引是對類 Peeps 中的個體向量的索引。Peeps類保留了一個struct Indiv的容器,但除此之外,它對個體的內部工作一無所知。
- 每個個體都由 struct Indiv 的一個實例表示(參見 Indiv .h 和 Indiv .cpp )。Struct Indiv 包含一個個體的基因組,對應的神經網絡大腦,以及在二維網格中個體 X、Y 位置的冗余副本。它還包含一些個人的其他參數,如“響應性”水平、振蕩周期、年齡和其他個人參數。
- Struct Indiv 知道如何在模擬開始時將一個人的基因組轉換成其神經網絡大腦。它還知道如何在模擬過程中以文本格式將基因組和神經網絡大腦打印到標準輸出。它還有一個函數 Indiv::getSensor() ,用于計算每個模擬器步驟的單個輸入神經元。
- 所有模擬器代碼都位于 BS 命名空間中(“biosim”的縮寫)。
配置文件
- 默認情況下,名為 biosim4.ini 的配置文件包含模擬運行的所有可調參數。biosim4 可執行文件在啟動時讀取配置文件,然后在模擬期間監視它的變化,在模擬運行期間可以修改許多參數。
- 類ParamManager(參見 params.h 和 params.cpp) 管理配置參數,并通過 ParamManager::getParamRef()? 提供的只讀指針,讓這些參數對模擬器可用。
- 有關每個參數的文檔,請參閱所提供的 biosim4.ini 文件。
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